“朕”是第一人称代词。不分尊卑贵贱，人人都可以自称“朕”。从嬴政规定后，一般人不能自称“朕”了。就这个字的使用，众臣更感到嬴政的骄傲和威严。
“朕为始皇帝，后世以计数，二世、三世至于万世，传之无穷。”嬴政又对诸臣说。
秦始皇又规定：皇帝父为“太上皇”；皇帝住所为“宫”，居城为“都”。皇帝下行文书之命为“制”、令为“诏”。下属给皇帝的上行文书为“奏”。皇帝的印章称“玺”，玉制。臣下印章称“印”或“章”，用玉以外的材料制作。
秦始皇对皇帝的仪仗、车马、服饰，以及百官的服饰做了规定。他还建立了避讳、朝仪等尊君抑臣的制度，大大加强皇帝的独裁专制权威。
国家统一了，对地方如何管理呢？丞相王绾提出沿用周代的分封制：“诸候初破，燕、齐、荆地远，不为置王，毋以填之。请立诸子，唯上幸许。”意思是，刚刚推翻六国政权，燕国、齐国、楚国距离秦遥远，不分别在这些地方分封诸候王，就没有办法镇得住它们。请求分封诸子为诸候王，希望得到皇上允许。王绾认为分封诸候王是巩固新兴政权的好办法，应该继续周王朝以来的分封制。
“众臣以为如何？”秦始皇把这个问题交给大家讨论。
“这样好。”“应该这样。”诸臣都纷纷支持丞相王绾意见。只有李斯提出不同意见：“周文、武所封子弟，同姓甚众，然后属疏远，相攻击如仇雠，诸候更相诛伐，周天子弗能禁止。今海内赖陛下神灵一统，皆为郡县，诸子功臣以公赋税重赏赐之，甚足易制。天下无异意，则安宁之术也。置诸候不便。”
秦始皇看看众臣，说：“天下共苦战斗不休，以有候王。赖宗庙，天下初定，又复立国，是树兵也。而求其宁息，岂不难哉！廷尉议是。”
于是决定全国实行郡县制，分天下为三十六郡：
河东、太原、上党、三川、东郡、颍川、南阳、南郡、九江、泗水、钜鹿、齐郡、琅邪、会稽、汉中、蜀郡、巴郡、陇西、北地、上郡、九原、云中、雁门、代郡、上谷、渔阳、右北平、辽西、辽东、南海、桂林、象郡、邯郸、砀郡、薛郡、长沙筆蒾樓
郡设郡守(掌管行政及全面)，郡尉(辅佐郡守管军事)，郡监(管监察)。郡下又设县、乡(亭)、里。共四级基层政权。县设县令(一县之长)，县丞(相当副县长)，县尉(管司法)。
秦朝的中央政权机构分为三公九卿。三公是丞相、